在西南地区高等教育格局中，多所院校依托地域优势形成了独特的学科特色。四川大学的医学学科群在西南地区首屈一指，其口腔医学专业凭借百年学科积淀，建有国家级重点实验室和临床教学基地，学科评估连续多年位列全国前三。
电子科技大学作为电子信息领域重点院校，在通信工程、电子科学与技术等专业形成完整培养体系，建有毫米波国家重点实验室，与华为、中兴等企业建立联合实验室，研究生率常年保持行业领先。
| 院校名称 | 优势学科 | 学科特色 |
|---|---|---|
| 西南财经大学 | 金融学 | 拥有西南地区唯一金融学国家重点学科 |
| 重庆大学 | 建筑学 | 建筑老八校成员，设有山地建筑重点实验室 |
| 云南大学 | 生态学 | 依托云南生物多样性资源建设学科 |
四川农业大学动物科学专业建有国家级动物生产实验教学示范中心，其动物遗传育种方向在全国具有重要学术地位。该校在熊猫等珍稀动物保护研究领域，与多个自然保护区建有联合研究基地。
西南政法大学的法学学科在全国第五轮学科评估中进入A类行列，其刑事法学科建有国家级司法鉴定中心，刑事诉讼法方向研究成果多次被立法机关采纳。
昆明理工大学的冶金工程专业依托云南有色金属资源优势，在真空冶金、微波冶金等方向形成技术突破，近三年获得省部级科技奖励12项。
贵州大学在植物保护专业建设中，融合大数据技术建立病虫害智能预警系统，其农林经济管理专业设置数字经济方向，培养复合型农业管理人才。
四川外国语大学的翻译硕士项目，特别开设"一带一路"沿线国家语言培养方向，与西南地区涉外企业共建实习基地，实现人才培养与产业需求对接。
